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倒置顯微鏡是為了適應化學醫(yī)學等領域中的組織培養(yǎng)，細胞離體培養(yǎng)，浮游生物，環(huán)境保護，食品檢驗以及流質沉淀物等顯微鏡觀察和研究的理想儀器。
由于上述樣品特點的限制，被檢物體均放置在培養(yǎng)皿（或培養(yǎng)瓶中），這樣就要求倒置顯微鏡的物鏡和聚光鏡的工作距離很長，能直接對培養(yǎng)皿中的被檢物體進行顯微觀察和研究。因此，物鏡，聚光鏡和光源的位置均顛倒過來，故稱為‘倒置顯微鏡“。到目前為止，倒置顯微鏡物鏡的最高放大率為40X，這是因為在光學設計中無法同時解決大數值孔徑和長工作距離的要求，一般40X物鏡的工作距離最大約在0.6mm。而倒置顯微鏡超長工作距離的40X物鏡可達7.4mm。對于聚光鏡來說，則要求其工作距離更長，如超長工作距離的聚光鏡，其工作距離可達55mm。
研究用倒置顯微鏡都配置有4X，10X，20X，40X長工作距離的平場消色差物鏡；目鏡常為廣角高眼點補償10X目鏡；聚光鏡為長工作距離消色差聚光鏡。由于被檢物體多為無色透明的活體物質，因此還附有恒溫控制箱，相襯，微分干澀，熒光及簡易偏光等附件，以達到不同的間檢效果。此外并附有顯微照相，電視錄象，電影攝影裝置，后兩者可記錄下活體的動態(tài)，以便研究之用。